災害情報システムは、ICT技術の進化と共に様々な問題を解決し多くの利便性と効果を期待されているが、その一方でシステム間の連係が複雑化し、正常時における利便性とは逆に、障害発生時の復旧の難しさと復旧時間の短縮という課題も残されている。
一般に情報システムの障害を回避する方策としては、ホットスタンバイ（同じ構成のシステムを2系統用意してバックアップ機も常に同期させておく）、コールドスタンバイ（同じ構成のシステムを2系統用意してバックアップ機は障害発生後に立ち上げる）、クラスタリング（複数のコンピュータを相互接続して作業負荷を分散させる）などで通信機器やサーバ、データベースを二重化するという手法が用いられ、同時にデータのバックアップを磁気テープ（MT）などの外部媒体に保存し、倉庫で保管するという運用が行われている。
情報システムに障害が発生した場合、データの復元は保管しているバックアップMTなどから、運用オペレータが手順に従い復旧作業を試みるが、その際、サービスの中断をどの程度まで許容し、データの喪失をどれだけ許容できるかは、あらかじめ想定しておくべき重要な要素となる。
しかし、災害発生時に手順通りの復旧作業を滞りなく進められるかには疑問も残る。阪神・淡路大震災では、バックアップMTを今にも崩れそうな瓦礫の山の中から取り出したという事例もあった。運用オペレータが平常時から様々な障害復旧の場面を想定し訓練を実施していても、肝心のデータを復旧できなければ災害情報システムを利用することすらできない。
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